Sie arbeiten eng mit Mitgliedern der AG Herzel zusammen und werden im Austausch mit anderen Gruppen des Instituts für Chemie und Biochemie stehen. Erwartete Qualifikationen Laufendes Studium der Biochemie, Biologie mit Fokus auf Molekularbiologie und/oder Mikrobiologie, Biotechnologie oder eines verwandten Studiengangs Starkes Interesse an bakterieller Genexpressionsregulation und Methoden zur Expressionsanalyse Praktische Erfahrungen im Molekularbiologielabor und im Arbeiten mit RNA Grundlagen im Umgang mit der command line / bash coding und Analysen in R Sorgfältige, strukturierte und selbstständige Arbeitsweise Motivation, sich aktiv in ein dynamisches, interdisziplinäres Forschungsteam einzubringen Sehr gute mündliche und schriftliche Kommunikationsfähigkeiten in Englisch Teamfähigkeit

Aufgabenbeschreibung Das Forschungspraktikum und/oder die Abschlussarbeit (B.Sc., M.Sc.) werden experimentelle und datenanalytische Aspekte aufweisen und knüpfen an Erkenntnisse zum hohen Einfluss von RNA Abbauintermediaten auf die finale Genexpression in Escherichia coli an (Herzel et al. NAR 2022, 10.1093/nar/gkac295). Ziel der Arbeit wird es sein eine RNA Sequenzierstrategie anzuwenden und zu evaluieren, die Transkriptionsänderungen und RNA Abbauintermediate gleichzeitig detektieren kann. Ihre Aufgaben umfassen u. a.: Anzucht und Ernte von Bakterienkulturen in verschiedenen Wachstumsbedingungen RNA-Extraktionen cDNA library Präparationen und Optimierung von Einzelschritten RNA-seq Datenanalyse basierend auf vorhandenem und neuzuentwickelndem Code Mitarbeit und regelmäßige wissenschaftliche Präsentationen in Arbeitsgruppentreffen